Desafíos en el Diseño de Enzimas: Más Allá de la Diversidad Estructural

Recientes avances en modelos de aprendizaje profundo, como AlphaFold3 de DeepMind, han revolucionado la predicción de interacciones biomoleculares, facilitando el diseño de moléculas similares a fármacos. Sin embargo, se ha descubierto que la diversidad estructural de las proteínas es menor de lo esperado, ya que muchas secuencias diferentes comparten la misma estructura. Esto plantea desafíos en el diseño de enzimas, sugiriendo que simplemente aumentar la cantidad de datos de secuencias no necesariamente incrementará la diversidad estructural. Se propone un enfoque más refinado para el muestreo y la agrupación de estructuras, destacando la necesidad de explorar más allá de los pliegues naturales existentes.